Diagnostická problematika se týká screeningu celiakie, Helicobacterové infekce, markerů kolorektálních tumorů, rizika atrofické gastritidy a karcinomu žaludku, aktivity akutní pankreatitidy, exokrinní funkce pankreatu, chronické pankreatitidy, laktózové intolerance, bakteriálního přerůstání v tenkém střevu a markerů, a dalších zánětů tlustého střeva.